Isocoros -Eq5---.pptx - Universidad Aut\u00f3noma de Nuevo Le\u00f3n Facultad de Ciencias Biol\u00f3gicas Patrones compositivos en genomas de vertebrados

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Patrones compositivos en genomas de vertebrados: conservación y cambio en la evolución Genómica Comparativa Docente: Felipe de Jesús Mares Rodríguez Ceres Arduizur Hernández López 1838865 Armando Nicolás López Acosta 1838870 Gabriel Neftali Flores González 1520167 Jesús Mario Villarreal Ríos 1518189 Miguel Ángel Garcia Cruz 1746113 Universidad Autónoma de Nuevo León Facultad de Ciencias Biológicas
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Los genomas de vertebrados son mosaicos de fragmentos grandes de ADN (200-300 kb) que se fraccionaron de acuerdo con sus niveles de GC. Estos fragmentos se denominan isocoros, y son muy MUY homogéneos cuando tienen un tamaño >3 kb. Análisis de secuencias fraccionadas (isocoros) GC GENOMA DE VERTEBRADOS SANGRE CALIENTE SANGRE FRIA 1/3 del genoma son isóforos ricos en GC Pocos isóforos ricos en gc o ausentes Muestran bandas de Giemsa Muestran bandas de Giemsa deficientes o ninguna banda VERTEBRADOS DE SANGRE CALIENTE ISÓFOROS RICOS EN GC ISÓFOROS POBRES EN GC Bandas ligeras de Giemsa (cromosomas en metafase) Bandas oscuras de Giemsa (cromosomas en metafase) Replicación temprana (ciclo celular) Replicación tardía (ciclo celular)
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El nivel GC se relaciona con los intrones o exones, así como las posiciones de los codones Los dobletes CpG (los sitios de metilación potenciales) son muy bajos en GC-pobres pero casi "estadísticamente abundantes" en secuencias codificantes ricas en GC. Los genes se concentran en las isocoras más ricas en GC de los genomas vertebrados de sangre caliente.
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En los vertebrados de sangre fría, las curvas de distribución de la composición de las secuencias de codificación y de los fragmentos de ADN son aproximadamente simétricas; En los vertebrados de sangre caliente, las secuencias codificantes ricas en GC representan la mayoría de las secuencias codificantes Análisis de las secuencias codificantes individuales GC y codones
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  • Spring '14

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