test 2 study guide -...

Info iconThis preview shows pages 1–3. Sign up to view the full content.

View Full Document Right Arrow Icon
Rough ER has lots of ribosomes attached to it, they synthesize both soluble and integral  membrane proteins, which are usually made for secretion to the outside of the cell, or for  other organelles.  The ER is also responsible for making lipids and storing Ca2+ ions. Lots of the proteins  and lipids made in the ER are sent to the golgi, where they go to their particular places.  Remember, the surface area to volume ratio has to be quite large for a cell to be able to  survive.  Sorting signals are important for determining fate of proteins synthesized. Synthesis of  all proteins begins with the ribosomes in the cytosol, except for the ones from the  mitochondria.  There are several types of transports:  Gated transport: proteins move between cytosol and the nucleus, topologically  equivalent, through nuclear pore complexes in the nuclear envelope.  Transmembrane transport: transmembrane protein translocators transport the protein  across a membrane from the cytosol into a place that’s topologically distinct. The protein  must usually unfold to go through the translocator. For example, transport from cytosol  to the ER lumen or mitochondria.  Vesicular transport: membrane enclosed sacs move proteins from one compartment to  another. The transfer of soluble proteins from ER to Golgi occurs like this. Movement  happens only between compartments that are topologically equivalent. Signals are obviously important: A signal sequence, usually at a max of 60 residues, must be present at the N-terminus  for the protein to get to the right location. A  signal peptidase  is also important, the  signal sequence must be removed when the protein is in the correct location.  Signal 
Background image of page 1

Info iconThis preview has intentionally blurred sections. Sign up to view the full version.

View Full DocumentRight Arrow Icon
patches  also allow so that the signal is not specifically in one place, but instead could be  in several places.  Proteins destined for the mitochondria have a signal sequence in which positively  charged amino acids alternate with hydrophobic ones.  Peroxisomes have a signal sequence at their C-terminus.  Sorting receptors usually recognize different classes of proteins rather than specific  proteins, so they have a wider choice of work.  How to know where a signal sequence ends up going: Take the signal sequence that’s unknown and attach it to various proteins that usually  reside in a specific part of a cell. Then, after cDNA encoding, the protein is transferred  into the cell and the location of the protein can be determined by immunostaining or cell  fractionation.  Organelles can’t me made from scratch:
Background image of page 2
Image of page 3
This is the end of the preview. Sign up to access the rest of the document.

This note was uploaded on 09/28/2009 for the course M 408c taught by Professor Mcadam during the Spring '06 term at University of Texas at Austin.

Page1 / 7

test 2 study guide -...

This preview shows document pages 1 - 3. Sign up to view the full document.

View Full Document Right Arrow Icon
Ask a homework question - tutors are online