Bio1 - E SCUE LA POL I T ECN ICA NAC IONAL NO MBRE: D ANIEL...

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Unformatted text preview: E SCUE LA POL I T ECN ICA NAC IONAL NO MBRE: D ANIEL LAGOS L L. B IO F IS ICA Análisis de la estructura molecular del archivo 2K8C Referencia del a rchivo 2 K8C: Structural Basis for Ubiquitin Recognition by a Novel Domain from Human Phospholipase A2-activating Protein. Autores: Fu, Q.S., Zhou, C.J., Gao, H.C., J iang, Y.J., Zhou, Z.R., Hong, J., Yao, W.M., Song, A.X., L in, D.H., H u, H.Y. PROP I EDADES D E LA α-H E L ICE (23 a 34) Figura 1. G ráfico New Cartoon del alfa hélice de la Ubiquitina. En la alfa hélice la secuencia de aminoácidos empieza por la Isoleucina (parte inferior) y termina con l a Glutamina (parte superior) . Número de Atomos Total= 202 Número de Atomos (Sin H idrógenos/Backbone)= 48 Número de Aminoácidos=12 Secuencia de Aminoácidos: Isoleucina, Acido Glutámico, Asparagina, Valina, L isina, Alanina, Lisina, Isoleucina, Glutamina, Acido Aspático, Lisina, Glutamina. Enlaces Peptídicos=11 Figura 2. Se muestra un enlace peptídico en la alfa hélice de la Ubiquitina. Los enlaces peptídicos definen planos de rotación. F igura 3. Se muestra un enlace de hidrógeno en el alfa hélice de la Ubiquitina. Nótese como el grupo N -H del aminoácido (n) puede establecer un enlace de h idrógeno con el grupo C=O del aminoácido (n+4). F igura 4. G ráfico CPK y New Cartoon del alfa-hélice de la Ubiquitina con sus cadenas laterales. Nótese como las cadenas laterales están dispuestas hacia el exterior de la hélice. F igura 5. G ráfico CPK del alfa-hélice de la Ubiquitina sin sus cadenas laterales. Nótese como los átomos de carbono se encuentran orientados en una dirección específica. Figura 6. V ista de la sección t ransversal del alfa-hélice de la Ubiquitina de un g ráfico VDW. Nótese que la hélice es una estructura compacta sin huecos. B IBL IOGRAF IA • www.wikipedia.org ...
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This note was uploaded on 01/02/2010 for the course BIO Biophysics taught by Professor Bayas during the Spring '09 term at York County CC.

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