TP3 - Introduccion al lenguaje R - Anlisis Exploratorio y...

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Análisis Exploratorio y Confirmatorio de Datos de Experimentos de Microarrays - Tp 3 Dpto. de Matemática - Instituo de Cálculo 1er. Cuatr. 2006 Dra. Diana M. Kelmansky 29 Trabajo Práctico 3 : Introducción al lenguaje R - cont. 4. Introducción a los Gráficos Uno de los poderes mayores de R es su capacidad gráfica. Veremos algunas de estas características en esta sección. 4.1 La ventana gráfica Cuando las imágenes se crean en R , se presentan en un ventana gráfica activa (active graphical device ). Si no está abierta el momento de ejecutar una fución gráfica, R abrirá una. Algunas de las características de la ventana gráfica son: Se puede imprimir directamente desde la ventana gráfica, o elegir copiar el gráfico al clipboard y pegarlo a un procesador de textos. Allí se puede modificar el tamaño del gráfico. También, un gráfico se puede guardar en distintos formatos como pdf, bitmap, metafile, jpeg, o postscript. Cada vez que se produce un gráfico nuevo, se pierde el anterior. 4.2 Dos funciones gráficas básicas Hay muchas funciones en R que producen gráficos y van desde las muy básicas hasta las más avanzadas y complicadas. En esta sección describiremos dos funciones básicas y en las siguientes veremos como embellecer los gráficos. En el capítulo 5 veremos otras funciones gráficas. 4.2.1 La función plot() La función más común para realizar un gráfico en R es la función plot() . Esta es una función genérica que se puede utilizar para realizar gráficos de dispersión (scatterplots), gráficos de series de tiempo, de funciones, etc. Si se da como argumento un único vector a plot() , los valores son graficados sobre el eje vertical y (ordenadas) contra los índices del vector ( index ) en el eje horizontal x (abscisas). Si son dados dos objetos vecoriales (de la misma longitud), se produce un gráfico de disperión bivariado. Por ejemplo consideremos nuevamente el dataset trees de R . Para visualizar la relación entre la altura y el volumen ( Height, Volume ), podemos we can dibujar un gáfico de dispersión: > attach(trees) > plot(Height, Volume) # el objeto trees está en el search path Aparece el gráfico en una ventana aparte:
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Análisis Exploratorio y Confirmatorio de Datos de Experimentos de Microarrays - Tp 3 Dpto. de Matemática - Instituo de Cálculo 1er. Cuatr. 2006 Dra. Diana M. Kelmansky 30 65 70 75 80 85 10 30 50 70 Height Volume La primera variable es graficada sobre el eje horizontal y la segunda variable es graficada sobre el eje vertical . Por defecto los nombres de las variables aparecen encada uno de los ejes. Este gráfico es extremadamente básico, pero la función plot() permite “vestirlo” simplemente cambiando los argumentos que la función tiene por defecto. Estos incluyen el agregado de títulos/subtítulos, el cambio de los colores de los caracteres gráficos (están disponibles más de 600 colores). Se puede consultar ?par para obtener una abrumadora lista con estas opciones.
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