marrayclass2 - Microarreglos Edgar Acuna UPR-Mayaguez

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Microarreglos Edgar Acuna UPR-Mayaguez math.uprm.edu/~edgar/esma683606.html
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La Expresión de un gene describe cuán activo es un gene. Los cambios en el funcionamiento de un organismo o célula se manifestarán con cambios en el patrón de la expresión de un gen. Esta es cuantificado por la cantidad de mRNA producido por el gene. Hay numerosas maneras de medir expresión genética tales como: análisis serial de expresión genética (SAGE), display diferencial, etc. El problema con todas estas técnicas es que no llevan a cabo una prueba simultánea de expresiones genéticas de varios genes. La tecnología de los microarreglos si permite este analizar simultáneamente miles de genes. Otras ventajas de los microarreglos es que ellos son pequeños y altamente sensitivos.
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Que es un microarreglo? El microarreglo constituye un arreglo bien grande de secuencias de fragmentos de DNA inmovilizadas y bien ordenadas y que están adheridas a una superficie sólida generalmente de cristal. Cada secuencia corresponde a un gene diferente.El material ordenado en el microarreglo es llamado “probe”. El mRNA es tomada de una célula o tejido particular combinado con algún tipo de “marcador” para generar una muestra etiquetada. Esta muestra es “hibridizada” sobre los “probes” del microarray. La muestra marcada será juntada con su secuencia complementaria. Luego para cada gene la cantidad del “marcador” es detectado y esto da un nivel de expresión del gene. Los microarreglos pueden ser divididos en dos tipos principales los cuales difieren en su construcción: Spotted Microarrays y arreglos oligionucletoideos de alta densidad.
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Ejemplo de un Microarreglo 132*44=5808 puntos
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Spotted microarrays (Micrroarreglos punteados) o cDNA microarrays (Schena, et al. 1995) Microarreglos punteados usan generalmente muestras de cDNA (DNA complementario) pero también pueden usar otras componentes del DNA. El cDNA es una molécula de DNA de una sola franja producida en el laboratorio usando mRNA como un molde (template) y transcripción reversa (sintetiza DNA a partir de RNA). Las longitudes de las secuencias son de 500 a 5000 bases. The first microarray paper (Schena, et al, 1995) featured the mustard plant, next studies included yeast, human and mouse. Now there are more than 100 organisms studied by microarrays analysis. Los arreglos de cDNA son producidos por reacción en cadena de polimerasa
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