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Chapter 6 - (virions (basic structure,somehaveextrastuff...

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Chapter 6- Virus Structure and Function  General Properties of Viruses (virions) Obligate intracellular parasite   made of nucleic acid surrounded by a protein coat. (basic  structure, some have extra stuff) Only replicate  inside host No nucleus, organelles, cytoplasm Viral genomes contain information for  taking over host cell information for  making viral proteins Capsid, genome replication proteins Virus Structure—Capsids Capsid-  protein coat  surrounding  the nucleic acid Capsid proteins  are arranged to give virion  symmetry   Icosahedral  capsids Roughly  spherical   20 equilateral  triangles or faces that come together to make a rough round shape  Many  animal viruses look like this Filamentous  capsids  Long  tube of protein , with genome inside  (instead of icosahedral capsid) Tube made up of  100’s of identical protein subunits Tube length reflects  size of viral genome
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Complex  capsids  Mixture of icosahedral & filamentous shapes Many  bacteriaphage (viruses that infect bacteria) Asymmetrical (irregular)  shapes Tend to be  larger viruses Poxviruses  (like smallpox) Virus Structure—Envelopes Envelope-  lipid bilayer around capsid of some viruses Allows  fusion to host cell  or organelle membrane  (in order to infect cell.  Fuses to either  cytoplasmic membrane or organelle membrane) Only occurs if host cell not covered by  cell wall Bacteriophages  are NON-enveloped  because they infect something  with a cell wall.  Plant viruses wouldn’t have one either) Envelope lipids come from  host (they take it from the host as they leave) Not  encoded by a viral genome But, proteins embedded in envelope   may be encoded by virus Coats viral capsid as virus leaves cell or organelle  (with cm as it leaves  the cell) Virus Structure—Genome DNA or  RNA Single-stranded (ss) or  double-stranded (ds)  (remember ours is double stranded) Linear or  circular Includes genes encoding   viral proteins capsid
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envelope proteins  if virus is enveloped Any  polymerase  not found in host cell Bacteriophage Life Cycles  (a lot of these things are specific to bacteriophage and do not apply  to animal viruses) 1.  Attachment to host cell receptor proteins Bacterial cell receptors normally used for  bacterial purposes (not something  that’s there for the virus to attach to)
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