Test 2 Spring 2009

Test 2 Spring 2009 - 11. COM 'l T e s tf 2 - M a l l e r y...

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Unformatted text preview: 11. COM 'l T e s tf 2 - M a l l e r y G l a s e r & A p r i l1 4 ,2 0 0 9 ED4 Bit 2ss-Q Spring 009 2 COM - PR EM F O R MS 1 ED4 11. D i r e c t i o n s F r o ma m o n g h e c h o i c e g i v e nf o r e a c hq u e s t i o n h o o s eh e g E S fa n s w e r . : t s c t - PR EM P a r t1 . D r .Gl a s e r ED4 11. COM s T h en e x tt h r e eq u e s t i o na r e r e l a t e d P y n e s . l m a g i n e o u h a v ea g e n eo f s t r u c t u r e COM - PR EM 1 ) D i f f e r e n t i a lp l i c i n o c c u r sn m a n y s g i - PR EM ED4 11. COM - PR EM ED4 11. W h e r el - Va r e E x o n s n d 1 - 4 r e p r e s e nitn t r o n sy o u n o t et h a t i n m u s c l eh e m a t u r em R N A a st h e f u l l s e q u e n c e V , a , t h lb u t i n l i v e ri t h a st h e s e q u e n c e l l - l V - Vy o u e x p e c t h a t i n t h e i n i t i a t r a n s c r i p t ? e l e ctth e b e s ta n s w e r : l; l S p b ( ) o i t t u r u n t r o t e i n s i n dt o E x o nl l l i n t h e i n m u s c l e b ) L i v e r o n t a i n s n u c l e a ss p e c i f i f o r E x o nl l l c a e c . c ) s m a l lR N Am o l e c u l e i n d s o E x o nl l l r e s u l t i n gn c l e a v a gte e d o u b l es t r a n d e d N A A b t i h R d ) a a n db a p p l y e ) a a n dc a p p l y - PR EM ED4 11. COM 2) F o rt h e s a m eg e n es h o w ni n t h e q u e s t i o n b o v e a m u t a t i o n e s u l t sn a m R N A h a t l a c k s x o nl V i n l i v e ra n d m u s c l e . a , r i t E T h e m o s tl i k e l y i t ef o r s u c ha m u t a t i o ni s ? s a ) I n E x o nl V b ) A t t h e b o u n d a r y e t w e e n n t r o n3 a n d E x o n b i 4 / E ) : B o t h r ep o s s i b l e a - PR EM ED4 11. COM g T h es a m e e n ea b o v e sa r e s u l t f a d e l e t i o n a c k s x o n . Y e t ,t h e m a t u r en r R N As f u n c t i o n a li , e .i t c o d e s o r a a o l E V i . f p r o t e i n .Y o ue x p e c t h a t ? ( p i c kb e s ta n s w e r ) a ) T h er e s u l t i n g R N A a c k s p o l yA t a i l m l a b ) I x o n l V c o n t a i n s i g n aflo r a d d i t i o n f a p o l yA t a i l o c ) T h e r ei s n o t e n o u g h n f o r n r a t i otn a n s w e r h e q u e s t i o n i o t ED4 11. COM 4) Topoisomerases? t o f 1 a )R e m o v eh e s t r a i n n t h e h e l i xt h a t r e s u l t sr o m D N Ar e p l i c a t i o n b ) R e w i n d N Aa f t e rt h e r e p l i c a t i o f o r k h a sp a s s e d y D n b c ) O p e nt h e D N Ah e l i xs o t h a t r e p l i c a t i o c a ns t a r t n COM - PR EM s 5 ) W h e nD N Af r a g m e n t a r e s e p a r a t e b y B e le l e c t r o p h o r e s t s , s e p a r a t i oo f f r a g m e n t d e p e n d s r i m a r i l y n ? d ihe p n s o ,t';) ize f fragment So b ) T h en u c l e o t i d s e q u e n c o f t h e f r a g m e n t s e e c ) B o t ha a n d b a p p l y MPRE MED 411 .CO MPRE M ED4 11. 6 ) l m a g i n eh a t y o u h a v ea D N Am i c r o a r r aty a t a l l o w s o u t o i d e n t i f y 0 , 0 0 0 i f f e r e n t N As e q u e n c ers n d o m l y y t h 2 d D a d i s t r i b u t e a c r o s sh e w h o l eh u m a ng e n o m e .Y o uu s et h i sa r r a yt o m e a s u r eh e a b u n d a n co f t h e s eD N As e q u e n c e s d t t e g i n h u m a nc e l l s r o w i n g y n c h r o n o u s liye .t h e c e l l s i v i d e t a p p r o x i m a t e t h e s a m et i m e . Y o ue x p e c t ? s ., d a ly a ) T h ec o n c e n t r a t i oo f a l l s e q u e n c ets i n c r e a s a t t h e s a m er a t e n o e b ) T h ec o n c e n t r a t i oo f s o m es e q u e n c ets i n c r e a s e a r l i e r n do t h e rl a t e r n o a c ) Y o ue x p e c t h e e a r l ys e q u e n c ets b e c l o s e r o o r i g i n s f r e p l i c a t i o n o t o ' d ) b a n dc a r ec o r r e c t .CO MPRE MED 411 .CO 7 ) Ub i q u i t i n s ? i a ) A m o d i f i e d a s en R N A b i b) A protease c ) A s m a l lp r o t e l n h i c hw h e n l i n k e d o o t h e rp r o t e i n s s u a l l ya r g e t sh e m f o r d e g r a d a t i oin l y s o s o m e s w t u t t n d ) A s m a l lp r o t e l n h a t s t a b i l i z eo t h e rp r o t e i n s t s / e f A s m a l lp r o t e i n h a t w h e nl i n k e d o c e l l u l ap r o t e i n su s u a l l ya r g e t sh e m f o r d e g r a d a t i oin p r o t e o s o m e s , t t r t t n MED 411 .CO P r o t e i n a r e n o r m a l l y e g r a d e dn a p a t h w a y h a t r e q u i r e s ? s d i t a ) T h en u c l e u s b) proteosomes c)MarkinB y ubiquitin b PRE q1 MPRE MED 411 p s h 8 ) A f t e rc o m p l e t i n g r o t e i n y n t h e s its e r i b o s o m a l u b u n i t s ? s /blAre separated a ) R e m a i n o u n dt o e a c ho t h e r b d)ATp e ) b , c a n dd a p p l y COM B i l2 5 5 s 0 9t e s t 2 - f o r m 1 - p g 2 - PR EM ED4 11. P 11. COM - PR EM ED4 11. COM f e r f a 1 0 ) Y o uh a v ed i s c o v e r ea n e wg e n ec o d i n g o r G l a s e r a s a ,p r o t e i n e q u i r e do r s u r v i v ailn B I O2 5 5 . Y o uo b t a i n D N A d f ragmentwith sequence' ATGCCTAAGGTA o t e s W h i l ey o u c o n t e m p l a tw h a t t o d o w i t h t h i si n f o r m a t i o n ,n e o f y o u r " f r i e n d s " t e a l sh e s e q u e n c a n dt e l l sy o u e a t e e a t t h a tf r o m i t h e c a nd e t e r m i n eh e a m i n oa c i ds e q u e n c o f G l a s e r a sa n d p r e p a r e n a n t i b o d y o i t b y s y n t h e s i z i n g e i e s m a l lp o l y p e p t i dc o d e db y t h i ss e q u e n c e .W h i c ho f t h e f o l l o w i n gs t h e s e q u e n c o f t h i sp o l y p e p t i d e ? b ) C y s L e u- A v g c ) Y o u rf r i e n dh a sn o c l u ea n dc a n n o t o t h i s d a ) l M e t- P r o- L y s V a l - PR EM ED4 s T h en e x tt w o q u e s t i o na r e r e l a t e d a ) A c r o s s i n k e d - Ab a s ep a i r l A l T b ) A c r o s si n k e d - Tb a s ep a i r COM lt i o 1 1 ) U l t r a v i o l e i g h tr e s u l t sn t h e f o r m a t i o n f ? - PR EM ED4 11. l a 1 2 ) F o rt h e a n s w e r t o t h e p r e c e d i n gq u e s t i o n t h e c r o s s i n k e db a s e s r e ? s c ) B o t hc a no c c u r b ) O n t h e s a m es t r a n d a ) O no p p o s i t e t r a n d s s 11. COM s T h en e x tt w o q u e s t i o na r e r e l a t e d COM - PR EM ED4 b i b 1 3 ) E x c i s l oo f d a m a g e d a s e sn D N Af o l l o w e d y r e p a i rr e q u i r e s ? n o o o a ) R e m o v a l f b o t hs t r a n d s f D N A , b ) R e m o v a l f o n e s t r a n d f D N A o c ) D N Al i g a s e COM - PR EM ED4 11. 1 4 ) T h e r e p a i r se q u i r e ? ( p i c k h e b e s ta n s w e r ) r t b ) A s p e c i aD N Ap o l y m e r a s e l n a ) T h en o r m a lD N Ar e p l i c a t i oc o m p l e x p , e ) b a n dc a p p l yp l u sA T P d ) a a p p l i e s l u sA T P COM - PR EM ED4 11. e f l n i l 1 5 ) T h em i n i m a D N As e q u e n c ers q u i r e do r a f u n c t i o n ac h r o m o s o m ie e u k a r y o t ic e l l s s ? , a ) T w o c e n t r o m e r e o , e t e l o m e r eo n e o r i 8 i no f r e p l i c a t i o n sn - - b ) T w ot e l o m e r e s ,n ec e n t r o m e r e n do n e o r i g i no f r e p l i c a t i o n o a m o o n c ) T w o t e l o m e r e s , u l t i p l e r i g i n s f r e p l i c a t i oa n do n e c e n t r o m e r e 11. COM - PR EM ED4 11. s t 1 . 6 T e l o m e r a sie a n e n z v m eh a t ? ) ( s) a ) A d d sa r a n d o m e to f b a s e s n u c l e o t i d e t o t h e e n d so f D N A s b ) A d d sr e p e a t e d e q u e n c e s t h e e n d o f D N A s to to s a s e c ) T h er e p e a t e d e q u e n c e sr e c o m p l e m e n t a r y a n R N A e q u e n c w h i c hi s p a r to f t e l o m e r a s e a ) F o u rr i b o n u c l e o s i dre p h o s p h a ta n d R N Ap o l y m e r a s e ti e c ) R e g u l a t o rp r o t e i n sh a t c o n t r o t r a n s c r i p t i o n y t l * € ) a , b a n dc a p p l y .CO MPRE M ED4 1 7 ) S y n t h e s io f R N Ar e q u i r e s ? s o n b ) P r o m o t ea n da n i n i t i a t i o n f t r a n s c r i p t i os i t e r d ) a a n db a p p l y .CO MPRE MED 411 m f e i o 1 8 ) T h eo r i g i n ae v i d e n c t h a t D N Ai s t h e g e n e t i c a t e r i a l o c e l l s s b a s e d n ? l b b ) A n a l y s io f c h r o m o s o m e s l - i ) T r a n s f o r m a t i oo f b a c t e r i a y D N A s a ) C h e m i c a ln a l y s io f D N A a s n pply d ) a a n db a MPRE MED 411 .CO MPRE MED 411 i e 1 9 ) T o c r e a t e t r a n s g e n ic o w t h a t w o u l ds y n t h e s i za h u m a np r o t e i n n m i l k ,y o u w o u l d ? a c a ) I n j e c t o t a lh u m a nD N Ai n t o t h e m a m m a r y l a n d B ( g n c d e b ) S e l e ce m b r y o n a l s t e me l l s E St)r a n s f e c t ew i t h h u m a n e n eu n d e rc o n t r o lo f a p r o m o t e r x p r e s s eid a l l t somatic ells i r i f f e l e c t E S e l l s r a n s f e c t ew i t h a h u m a ng e n eu n d e rc o n t r o o f a D N As e q u e n c s p e c i f i f o r p r o t e i n s e c r e t e dn l e c c t d m i l ks u c ha sl a c t a l b u m ia n dt r a n s f e t h e s ec e l l s o e a r l vb l a s t u l a s n r t d ) N o n eo f t h e a b o v e PRE MED 411 .CO c i 2 0 ) T h er i b o s o m e o n t an s ? a ) O n eb i n d i n g i t ef o r I R N A s 'b) T h r e eb i n d i n g i t e s o r t R N A ' s s f f c )T w o b i n d i n g i t e s o r t R N A ' s s COM _ B i t2 5 5 s 0 9 t e s t 2 _ f o r m 1 _ p g 3 - PR EM ED4 11. P 11. COM 2 1 ) I n g e n e r atlh e D N Ai n e a c hc e | |o f t h e b o d yo f a e u k a r y o t io r g a n i s m , r e x a m p r e c fo man? 'b) a ) l s d i f f e r e n itn e a c hc e l l t y p e l s t h e s a m ei n e a c hc e l l t v p e ED4 22) I n e u k a r y o t ic e l l sa l l R N An o l e c u l e s r e ? c , a b ) M a d e b y d i f f e r e n R N Ap o l y m e r a s e s t COM 23) D N AL i g a s ee q u i r e s ? r - PR EM a ) M a d eb y t h e s a m eR N Ap o l y m e r a s e a ) A n R N Ap r i m e r ED4 11. b) ATP 24) T r a n s p o s o n s e ? ar c)Viruses COM - PR EM a ) E n z y m ets a t c l e a v e N A h D b) DNAsequences that can move to differentlocations the genome in 11. COM - PR EM ED4 11. r 2 5 ) A g e n ec o n t a i n s e x o n sa m u t a t i o n e s u l t sn a d e l e t i o n 6 , r i o f t h e r a s te x o n . y o u e x p e c t ? a ) T h es y n t h e s io f a s h o r t e r r o t e i n s p b ) N o p r o t e i ni s m a d e c) Synthesis a shorterprotein if exon five hasa polyadenylation of signal d ) S y n t h e s io f a s h o r t e r r o t e i n f e x o nf i v e h a sa s i g n afro r t h e s y n t h e s io f a m e t h v r s p i s G cap COM - PR EM ED4 11. COM - PR EM ED4 2 6 ) W h i c ho f t h e f o l l o w i n g t a t e m e n ta r e c o r r e c t ? s s g a JE a c h e n eh a sa r e g u r a t o rp r o t e i n ( su n i q u e o t h a t g e n e ,i . e . t h e yd o n o t a f f e c ta n y y ) t o t h e rg e n e g b ) E a c h e n e ' s x p r e s s i oin r e g u l a t e d y o n e o r m o r er e g u l a t o r p r o t e i n s h i c ha l s oi n f l u e n c e e s b y w t n e e x p r e s s i oo f n o t h e rg e n e s c ) E a c h e g u l a t o rp r o t e i nr e c o g n i z e ss p e c i f i s e q u e n c e D N A r y a c in d ) a a n dc a r ec o r r e c t -e) b and c are correct COM - PR EM ED4 11. 2 7 )A p a r t i c u l a r s e t o f " l e u c i n e z i p p e r " r e g u l a t o r y p r o t e i n s i s c o m p o s e d o f t h r e e d i f f e r e n t c h a i n s A , B , C . Eachcanform h o m o d i m e ro r h e t e r o d i m e rw i t h o t h e rc h a i n sn t h e s e t . H o w m a n yd i f f e r e n t N As e q u e n c e s s s i D c a nt h a s a m i l yo f f r e g u l a t o rp r o t e n sr e c o g n i z e ? y i b )s c )6 - PR EM ED4 11. e 2 8 ) T h ep r e s e n c o f m u l t i p r e e t h y r y t o s i n ee s i d u e is a D N As e q u e n c e d i c a t ets a t i t i s ? m c r n in h /a)Transcriptionallysilent b)Transcriptionallyactive ED4 11. COM 2 9 ) D i f f e r e n t i a lp l i c i n gs c o n t r o l l e d y t i s s u e p e c i f i c r o t e i n sh a t b i n dt o s e q u e n c ej s i n t r o n s s i b p n s t a n d / o re x o n s ? a )T r u e b) False .CO MPRE M 3 0 ) S m a lR N A ' s a n ? l c a) preventthe translation specific of mRNA,s b ) t h e yt a r g e ts p e c i f i m R N A ' so r d e s t r u c t i o n c f ; c ) B o t ha p p l y MPRE MED 411 T h en e x tt w o q U e s t i o na r e r e l a t e d s MED 411 .CO MPRE MED 411 .CO 3 1 ) Y o ul i n ka 1 0 0n u c l e o t i d D N As e q u e n c t h a t p r e c e d etsh e b e g i n n i n o f t r a n s c r i p t i o n s e e g l o f t h e g - g a o p e r o ni n F . c o ltlo the genefor humanserumalbuminand introducethe constructinto E.coli.you measure the presence an RNA of t r a n s c r i po f t h e a l b u m i n e n eu n d e ra v a r i e t y f c o n d i t i o n a n de x p e c t ? t g o s c a r e f u l l a n d p i c kt h e b e s ta n s w e r ) y {think a ) Y o uf i n d t h e R N Au n d e ra l l c o n d i t i o n s . e . , r a n s c r i p t i oin c o n s t i t u t i v e i, t s b ) Y o uo n l yf i n d t h e R N Ai n c e l l s x p o s e do l a c t o s e e t 'c) Y o uo n l yf i n d t h e R N Ai n c e l l s x p o s e do l a c t o s en t h e a b s e n c e f s l u c o s e e t i o d ) T h ec e l l s e v e rm a k et h e R N A n MED 411 .CO MPRE l n t h e s a m ee x p e r i m e n to u ,e x a m i n eh e c e [ s f o r t h e i r a b i r i t yo m a k es e r u ma r b u m i n . y t t a ) \ T h e e l l s n l ym a k es e r u ma l b u m i n n t h e p r e s e n c o f l a c t o s e c o e i b ) T h ec e l l s a k es e r u ma l b u m i n n t h e p r e s e n c o f g l u c o s e m i e c ) T h ec e l l sn e v e rm a k es e r u ma l b u m i n PRE X / COM - PR EM ED4 11. P B i l2 5 5 s 0 9t e s t 2 - f o r m I - P g4 MPRE M ED4 11. COM a a t i s 3 3 ) M a n yo f t h e p r o t e i n sn e u k a r y o t ea p p e a r o h a v er e l a t e d m i n oa c i ds e q u e n c e s ,s f o r e x a m p l et,h e h e m o g l o b i n s , d o T a u p r o t e i n sh a t o t h e r w i s e p p e a r n r e l a t e d . h eo r i g i n f t h e s ep r o t e i n s u r i n g t n s s o r s t r e t c h eo f s i m i l a r e q u e n c ei s d i e v o l u t i o ns m o s tl i k e l y u et o ? evolution mutagenesis d) a and b followedby separate Exonshuffling b) Geneduplication c) Random a) MED 411 .CO w t f 3 4 ) A c D N Al i b r a r y r o m l i v e rc o m p a r e do m u s c l e i l l ? , t s b ) S o m ec o m m o ns e q u e n c ea n d s o m ed i f f e r e n s e q u e n c e s t o f t o t a l l yd i f f e r e n D N As e q u e n c e s a)Consist MED 411 .CO MPRE o g n e 3 5 ) T h ed i d e o x v u c l e o t i d m e t h o df o r s e q u e n c i nD N Ai s b a s e d n ? n n e a e o f D N Ap o l y m e r a sa c t i o n f t e ra d i d e o x y u c l e o t i d i s i n c o r p o r a t eid t o D N A t a ) T h ec h a i n e r m i n a t i o n in length yonenucleotide b h n b ) T h es e p a r a t i oo f D N Am o l e c u l ets a t d i f f e r s g e e c ) T h ek n o w l e d g o f t h e b e g i n n i n s e q u e n c o f t h e D N At o a l l o wt h e s y n t h e s io f a p r i m e r MPRE e ) a , b a n dc a P P I Y d ) a a n db a p p l y 411 .CO s T h en e x tt w o q u e s t i o n a r e r e l a t e d : MED 411 .CO MPRE MED h a G ds h a s 3 6 ) L i p i d o l u b l e o r m o n e s f f e c tg e n et r a n s c r i p t i o n . l u c o c o r t i c o i a n dt h y r o x i n e r e l i p i ds o l u b l e o r m o n e s , l n t a ) T h e ya f f e c t e n e r a n s c r i p t i oin i d e n t i c am a n n e r S a a h o r m o n e s c t a sZ n - .f i n g e rt r a n s c r i p t i ofn c t o r s o b ) T h e i rr e c e p t o rfs r t h e s e g l u c o c o r t i c or d c e p t o irs i n t h e n u c l e u s ie ts e e c ) I n t h e a b s e n c o f g l u c o c o r t i c o i d h, r t o d ) I n t h e a b s e n c e f t h r y r o x i n eh e t h r y r o x i n €e c e p t o irs i n t h e n u c l e u s MPRE e ) b a n dd a r e c o r r e c t MPRE MED 411 .CO D a T h er e c e p t ofro r t h r y r o x i n e n dV i t a m i n ? p s A c t a s h o m o d i m e r s c ) A c t a s h e t e r o d i m e rw i t h o t h e rD N Ab i n d i n g r o t e i n s a c a)Affect hromatin cetylation b) e ) a a n dc a r ec o r r e c t d ) a a n db a r ec o r r e c t MPRE MED 411 .CO t l t } ! j w n " n m R N A se a v e h e n u c l e u s ?{ p i c k h e b e s ta n s w e r ) / ' b ) T h e yh a v ea p o l yA t a r l a ) T h e vl a c ka p o l vA t a i l n m p o l yA t a i l t h a t i n s o m ec a s e s a yb e l e n g t h e n eid t h e c y t o p l a s m c ) T h e yh a v ea MPRE MED 411 .CO t e d o r l 3 9 ) S o m em u t a t i o n sn t h e c o d i n g e g i o n f m R N A o n o t a f f e c t h e a m i n oa c i ds e q u e n c o f t h e p r o t e i n h a t i s c o d e db y , o i i r, t h e m e s s e n g ey e t t h e ym a y r e s u l t n a m a j o rc h a n g en t h e f u n c t i o n f t h e g e n e T h i si s d u et o ? n b ) C h a n g eis s p l i c i n g c i o a ) T h ef o l d i n g f t h e m R N A n t o a n i n a c t i v e o n f o r m a t i o n or S g a t o g n c ) C h a n g eis s p l i c i n c a nb e d u e t o t h e a c t i o n f p r o t e i n sh a t f u n c t i o n s ( E x o n p l i c i nS t i m u l a t o r s ) a s e ) b a n dc a r e c o r r e c t MED 411 .CO S g E 5 l{ E x o n p l i c i n I nhi b i t o r s ) d ) a a n db a r ec o r r e c t .CO MPRE h s y ph g 4 0 ) F l u o r e s c e n t o t ob l e a c h i nr e c o v e r e x p e r i m e n td e m o n s t r a tte a t ? freelyin the plainof the membrane of membranes cellscandiffuse a) All proteinsin the cytoplasmic f c s c i S o m ep r o t e i n sn t h e c y t o p l a s m im e m b r a n eo f c e l l s a nd i f f u s e r e e l yi n t h e p l a i no f t h e m e m b r a n e b) MPRE MED 411 p t a c ) S o m e r o t e i n s r el i n k e d o t h e c y t o s k e l e t o n a n dc ap p l y fl)b MPRE MED 411 .CO c h A c . - a ) l w a y s a v ei d e n t i c a l o m p o s i t i o n o 4 1 , T h et w o l i p i dl e a f l e t s f t h e c y t o p l a s m im e m b r a n e ? ) c y t o p l a s m is i d eo f t h e m e m b r a n e c o ar c ) G l y c o l i p i d s ea l w a y s n t h e h t b ) A l w a v s a v ed i f f e r e n c o m p o s i t i o n 'd) b a n dc a p P l y PRE MED 411 .CO o , s y 4 2 ) W h e np h o s p h a t i d e lt h a n o l a m i nie p r e s e n itn a l i p i db i l a y e ry o u e x p e c t h e e t h a n o l a m i nte b e ? p b) Intheaqueous hase o a )A t t h e c e n t e r f t h e b i l a v e r COM B i l2 5 5 s 0 9 t e s t 2 - f o r m 1 - p g 5 - PR EM ED4 11. P COM p a r t2 . D r .M a l l e r y - PR EM ED4 11. 4 a ) N 4 i t o c h o n d rD N A ? a ) h o l d s b o u t3 , 7 0 0c o d i n g e n e s ial g a f b ) c o d e s o r a b o u t2 0 %o f t h e m i t o c h o n d r i a lr o t e i n s p c ) c o n t a i n o n l ys h o r tt a n d e mr e p e a t s c ) c o n t a i n s 0 b i l l i o n u c l e o t i d p a i r s s 3 n e e ) n o n eo f t h e s ei s c o r r e c t ED4 11. COM 4 { l W h i c ho f t h e s e s a n o n - p r o t e i b o u n dm o b i l e h y d r o g e n a r r i e o f t h e m i t o c h o n d r i a l e c t r o n a r r i e r y s t e m ? i n , c r e c s i a)FADH C b ) c y t o c h r o m e - a , c ) u b i u q u i n o n(e o Q ) d ) f l a v o p r o t e ia s F M N n e ) n o n eo f t h e s e - a )t r u e b )f a l s e COM - PR EM m 4 5 ) P r o t o n s o v et h r o u g h h e F 0s u b u n i o f A T Ps y n t h a s d u r i n g T Ps y n t h e s i s ? t t e A - PR EM ED4 11. COM - PR EM ED4 11. 4 6 ) W h i c ho f t h e f o l l o w i n g t a t e m e n tis c o r r e c a b o u tt h e p r o t o nm o t i v ef o r c ea c r o s s i t o c h o n d r i a l e m b r a n e s s s t m m g e n e r a t e d y c h e mo s m o s i s ? b i a ) i t c r e a t e s p H d i f f e r e n t i a lf a b o u t1 . 0t o 1 . 4u n i t s a o l b ) i t c r e a t e s p o t e n t i ad i f f e r e n t i a lf a b o u t1 4 0m V i n s i d e e g a t i v e a o n c ) i t c r e a l e s n N A D P H o n c e n t r a t i oh i g h e r n t h e c y t o p l a s m a n t h e c h l o r o p l a s m a c n i th / d)botn a and b are correct e ) a , b , a n d c a r ec o r r e c t ED4 11. COM o l c a a t e i \ | \ w n e n a m o l e c u l e f c h l o r o p h yiln a n a n t e n n a e o m p l e x b s o r b s p h o t o no f l i g h t , h e e x c i t e d l e c t r o ns r a p i d l y t r a n s f e r r efd o m o n e c h l o r o p h ym o l e c u l eo a n o t h e ru n t i li t r e a c h e t h e p h o t o c h e m i c r e a c t i o n e n t e rb y ? r ll t , al s c a ) f l u o r e s c e n c eb ) p h o s p h o r e s c e n c e ) p h o t o i o n i z a t i o nd ) r e s o n a n c e e ) n o n eo f t h e s e c Iracteriorhodopsin ( l n a r e c o n s t i t u t e d t i f i c i am e m b r a n e e s i c l es e e i g t o r i g h t ) o n t a i n i n g ar l v f c j un c o u p l i n g y b a c t e r i o r h o d o p s in dA T Ps y n t h a s e ,o u a d da h y d r o g e n n c o u p l i na g e n ta s an u g agent (l . d i n i t r o p h e n o D N P ) A s s u m i ntg e p H i s l o w e ri n s i d e h i sv e s i c l eh a no u t s i d e ? h t t i a ) p r o t o n s i l l d i f f u s e n t ot h e v e s i c l en t h e d a r k w i b ) a sm u c hA T Pw i l l b e m a d ea s n o r m a lb y t h e A T Ps y n t h a s e t h e d a r k in , c ) t h e p H i n s i d e h i sv e s i c l e i l l i n c r e a s i n t h e l i g h t t w e ATP sfmthase d ) s u b s t r a t e v e lp h o s p h o r y l a t i o n l l o c c u r le wi e ) n o n eo f t h e s ei s c o r r e c t - PR EM ED4 11. COM - PR EM ED4 11. COM - PR EM aq l^. 11. COM il 4 9 ) I n n o n - c y c l ie l e c t r o nl o w i n p h o t o s y n t h e se se c t r o nl o w i s ? a ) f r o m P S t o P Sl l c f - b ) f r o m N A D P Ho A T P f t N e - c ) f r o m w a t e r ' s r e d o xp o t e n t i a l t o A D P " 5 d ) f r o m A T Ps y n t h a s t o A D p e ) n o n eo f t h e s ei s a c o r r e c c h o i c e t -. 411 .CO MPRE M ED4 5 q ) T h ee n z y m e e s p o n s i b l e r t h e r e d u c t i o n f c a r b o n i o x i d en C 4 p l a n t s s ? r fo o d i i a ) R uB Pc a r b o x y l a s e l y on b) PEP arboxylase ly c on c ) R u B P n dP E P a r b o x y l a s e a c R d) neither uBP orPEP arboxylase n c e ) n o n eo f t h e s ei s a c o r r e c c h o i c e t MED 2 n d b a s ei n c o d o n PRE MED 411 .CO MPRE MED 411 .CO MPRE MED 411 .CO MPRE U o o ; U c I A G c Plre Phe Leu Leu Ser Ser Leu Leu Leu Leq lle lle lle Msl Val Val V6l Val Pro Plo Pro Pro Thr Thr tnl Ser Ala Aa Aa Aa A ryl Tyt SIOP STOF tlis His Gln Asn Lvs Lys Asp Ast 6lu Gl( G cyt q: sT0p U tl o TrD a'g ar9 Ar! aro U Ser Set Ato Arg U Glv Glv Glv clv U |^ c o c tl o - PR E COM 11. ED4 - PR EM COM 11. ED4 - PR EM COM 11. ED4 - PR EM |coNSENIToHAvEMYGBADEPoSTEDaYMY|'D'NUMBERoNAcLAsSRosTE|l'lE.o]t' SIGNATURE COM OATE ED4 11. ON MY HONOF, I HAVE NEITHIR GIV|N NOFI RTCTIVED AID ON THIS EXAMTNAI ION - PR EM SIGNATUBE ABCOE COM 100@o@ ABCDE SIDE 1 ABCDE 11 OOOO O ABCOE - PR EM ED4 11. ,o@oo@ l r o o o o o ABCDE PRE MED 411 .CO MPRE MED 411 .CO MPRE MED 411 .CO MPRE MED 411 .CO MPRE M ED4 11. COM 300000 AsCOE 4c@o@o AACDE 50@@@o AACDE 60@ooo AACOE 700@oQ AACDE 80@ooo ABCOE ABCDE 13OOOOO ASCDE T4OOOOO AECOE IsOOOO@ ABCDE 16O@0OO ABCDE ABCDE 2 rO O O O O ABCDE ABCDE i8O@O@O ABCOE ABCDE 20OOOOO AACOE 31 00@@ 0 ABCDE 22ooo@o 320@ooo AACDE ,3OOOOO ABCDE 24OOOOO AACOE ,5OOOOO AACDE 26OOO@O AACDE 17O@O@O 27O@aOO sooo@o l s o @ o o o 1000ooo ABCDE AACOE 28(DOOOO ABCOE ABCOE 41 a@@@ 0 AACDE 42 0000 0 ABCDE 33(o@oo@ 43 o@oo 0 ABCDE 34 co@o O AACDE rso@@@o AECDE 360@o@G AECDE 370@o@o ABCDE 380@@@o AACOE ABCDE ABCDE ASCDE ABCDE 44 @ooo 0 ABCOE 45ooooo ABCDE 46000eo AECDE 470@ooo ABCDE ( 4 8t o o o @ ABCDE 2e(Doooo 3so@oo@ 4so@c@o 30O@O@O 40000c@ AACDE 5000ooo ...
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