BI213Unit2

BI213Unit2 - BI213:Exam2Review DNAREPLICATION

Info iconThis preview shows pages 1–3. Sign up to view the full content.

View Full Document Right Arrow Icon
BI 213: Exam 2 Review DNA REPLICATION - DNA replication is semi-conservative DNA Polymerase:  catalyzes 5’ dNTP(deoxyribosenucleotide) joining to form growing DNA  chain Only 5’   3’ (adds to 3’ –OH) Only adds dNTP when there is a preformed primer strand Binding of correctly mtched dNTPs induces change in conformation and increases accuracy in  discrimination RNA Polymerase:  synthesizes RNA chain without a primer RNA polymerase begins synthesis   chain is made   enzymes cut out RNA   serves as  primer for DNA polymerase   DNA fragment made   ligase Replication Fork:  regions of active DNA synthesis where parental strands of DNA separate and  2 daughter strands are synthesized Lagging strand Leading strand:  continuously synthesized strand Its movement exposes template for synthesis of lagging In E. coli – polymerase III does leading and lagging strands Clamp-loading protein:  binds to DNA polymerase on both leading and lagging strands and  opens up rigns, recognizes junctions of primers and holds the  sliding clamp:  holds polymerase  on DNA Okazaki Fragments:  small pieces of newly synthesized DNA added to  lagging strand Primase:  enzyme that synthesizes short RNA fragments complementary to lagging strand  template at replication fork Exonuclease:  can hydrolyze DNA (or RNA) in either 3’   5’ or 5’   3’ (on both leading and  lagging strands) Polymerase I:  removes RNA primers (prokaryotes) RNase H:  removes RNA primers (eukaryotes)
Background image of page 1

Info iconThis preview has intentionally blurred sections. Sign up to view the full version.

View Full DocumentRight Arrow Icon
Helicase:  catalyzes unwinding of parental DNA Coupled to hydrolysis of ATP Single-Stranded DNA-binding proteins:  stabilize unwound template DNA; keep DNA  extended and single-stranded Topoisomerase:  catalyzes reversible breakage and rejoining of DNA strands  Prevents problem of DNA twisting around itself during replication Makes nicks in DNA   swivels so strands can rotate and replication fork can proceed  Proofreading:  performed by DNA polymerase  Use exonuclease activity that can hydrolyze DNA in 3’   5’ direction and requires a primer H- bonded to template strand Origins of replication:  binding site for proteins that initiate replication process E. coli = ori binding site for initiator protein (1 origin) Yeast = origins identified via in vitro mutagenesis with plasmids Humans = multiple origins – forks moving in opposite directions Autonomously Replicating Sequences (ARS):  support replication of plasmids in transformed  cells Origin Replication Complex (ORC):  6-subunit protein that recruits other proteins to the origin  and initiates DNA replication Telomeres:  terminal sequences (tandem repeats of simple sequence DNA) of linear 
Background image of page 2
Image of page 3
This is the end of the preview. Sign up to access the rest of the document.

Page1 / 16

BI213Unit2 - BI213:Exam2Review DNAREPLICATION

This preview shows document pages 1 - 3. Sign up to view the full document.

View Full Document Right Arrow Icon
Ask a homework question - tutors are online