onionsrock - Trial1

Info iconThis preview shows pages 1–2. Sign up to view the full content.

View Full Document Right Arrow Icon
Trial 1 The purpose of this lab was develop and troubleshoot a protocol that to successfully extract DNA  from an onion. An onion in particular was used to see how extraction in a plant generally differs  form extraction from bacteria like that form E. coli cells and animals like that from Salmon  sperm. Onions happen to be ideal because they have a low starch content which allows the DNA  to be clearly seen when spooled. In the first trial, procedures gathered from Iowa State  University were followed exactly. The basic procedure consisted of immersing 1 gram of onion  in a homogenizing solution containing sodium dodecyl phosphate, sodium chloride, sodium  citrate ethylenediamine tetraacetic acid (EDTA) and water. The salt in particular allows nucleac  acids to precipitate out of an alcohol solution because it shields the negative phosphate end of  DNA causing it to coalesce together. Next, one leaves the mixture for 10 minutes in a hot water  bath at 55-60ºC to soften the phospholipids in the cell membrane and denature DNAse enzymes  that would cut DNA into fragments too small to be extracted. After heating, one is to cool the  mixture on ice to slow down the break down of DNA to make sure it is spoolable and not  fragmented and then grind the onion with a mortar and pestle to break down any cell walls 
Background image of page 1

Info iconThis preview has intentionally blurred sections. Sign up to view the full version.

View Full DocumentRight Arrow Icon
Image of page 2
This is the end of the preview. Sign up to access the rest of the document.

Page1 / 2

onionsrock - Trial1

This preview shows document pages 1 - 2. Sign up to view the full document.

View Full Document Right Arrow Icon
Ask a homework question - tutors are online