Replicase has 2 catalytic cores 2 or more polymerases

Replicase has 2 catalytic cores 2 or more polymerases at replication fork
DNA is packaged in nucleosomes
 primers are removed by ribonucleases
 Telomeres
 The ends of linear chromosomes in eukaryotes
 Are composed of many repeats of a 6 bp sequence (TTAGGG) followed by a G-rich
stretch
 They form T-loop structures that together with proteins (shelterin complexes)
protect the ends from degradation by exonucleases
 DNA ends cannot be fully replicated because of the need for a primer, therefore
results in ends growing shorter with each cell division
 Telomerase maintains these ends by adding the 6- bp sequence repeatedly in
numerous cycles using an RNA template and its reverse transcriptase activity

 Functions of RNA
 mRNA: messenger RNA  (codes for proteins)
 tRNA: transfer RNA (adaptor between nRNA and amino acids)
 rRNA: ribosomal RNA (catalyze protein synthesis)
 hnRNA: heterogenous nuclear (intermediate form and pre mRNA process to make
mRNA)
 snRNA: small nuclear (needed for mRNA maturation, part of the spliceosome)
 miRNA: micro RNA (controls gene expression)

 RNA polymerase
 Does not require a primer
 Synthesizes RNA from a DNA template in 5’ 3’ direction using rNTPs
 Uses the template strand to specify which rNTP to add
 Rna product is identical to the non-template strand (also called coding strand) but
has U replacing T
 Forms phosphodiester bonds
 Transcription in Prokaryotes
 A single RNA polymerase (alpha2betabeta’ core enzyme + sigma factor)
 Sigma factor responsible for promoter recognition
 Sigma factor binds -35 (TTGACA) and -10 (TATAAT) sequence on the non
template strand positioning the polymerase relative to the +1 nucleotide (A) where
transcription can begin
 RNA polymerase core enzyme elongates the RNA transcript
 Termination can occur by a Rho- dependent or Rho-independent mechanism
 Rho-independent termination uses the formation of an RNA hairpin structure
resulting from the transcription of an inverted repeat sequence to slow the
polymerase, which then causes the RNA transcript to disengage from the polymerase
through disruption of the weakly bonded U:T repeat sequence in the transcription
bubble
 Rho-dependent termination requires the binding of the rho protein to a specific
sequence near the 3’ end of the RNA followed by its movement towards the
polymerase causing it to disengage
 Transcription and translation are coupled in bacteria (since they are not physically
separated as they are in eukaryotes)


 Rho- Independent

 Rho-Dependent

