Antibodies

This preview shows page 41 - 45 out of 164 pages.

antibodies How is the enormous diversity required actually generated? ONE example is the  production of a single immunological light chain
20:58 Assembly of a light chain **BUT these cells are diploid Textbook doesn’t tell you WHY.  In all cells in the body there are particular immunoglobulin genes ~300 variable regions
20:58 o each has a promoter region (recognized by RNA polymerase), coding  region (~100 amino acids), and a palindrome (came from a virus  thing/transposable element or jumping gene ~4-5 joining regions o same palindrome at the end of each variable regions, coding region  (~20 amino acids), RNA splice site constant region o in front of it is another splice site, enhancer sequence is in front of that this is the same for all cells’ DNA except mature B Cells in mature B cells there is  somatic recombination   dna is folded (298 th  V region next  to 4 th  J region)  recombinase (B lymphocyte specific) is only in B cells. RAG1 (recombination), RAG2,  DNA kinase, ligase, DNA repair proteins all involved.  Cuts at the palindromic recognition site on the 298 th  V section and is cutting upstream of  the coding region and the J regions (other palindromes) then those parts are joined and  the loop is lost.  Enhancer helps RNA polymerase bind the closest promoter then the primary transcript  is also spliced to exclude the last J  Ultimately there is a V,J,C region of a light chain Each B lymphocyte makes its unique antibody – allelic exclusion lymphocyte  recombinase is an activator Gene assembly, novel joints and hypermutation together produce a huge number of  different immunoglobulin light chains: summary 1. Gene assembly increases diversity o Coding regions for antigen binding sites are assembled to generate  genes that can be transcribed o The enzymes for the assembly are expressed only in developing  lymphocytes 2. Joining of cut domains is not always precise, resulting in different amino  acid sequences at ‘novel joints’ 3. ‘Hypermutation’ is a result of point mutations (C to T) during DNA  replication, which in turn changes amino acid sequence Assembly of the heavy chain is even more complex with 500 V regions and two  types of J regions (= joining and diversity regions) 
20:58 Quiz: in a particular B lymphocyte the 300 th  V region is joined to the 3 rd  J region.  Draw the primary transcript and the mature mRNA corresponding to the light chain of  the mature plasma B lymphocyte Week 5 Lecture 1  you did your Connect assignment (on the nervous system, review of ion transport,  circulation and respiration) 

  • Left Quote Icon

    Student Picture

  • Left Quote Icon

    Student Picture

  • Left Quote Icon

    Student Picture